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開發(fā)出有望識別致癌病原體的新方法

2019-11-05 13:51來源:生物谷


近日,一項刊登在國際雜志Genome Biology上的研究報告中,來自東英吉利亞大學等機構的科學家們通過研究開發(fā)了一種新方法來尋找與癌癥相關的細菌和病毒。

    

如今研究人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn),某些感染與癌癥發(fā)生直接相關,比如胃癌和宮頸癌等;這項研究中,研究者通過研究揭示了如何對來自腫瘤的基因組數(shù)據(jù)進行測序來揭示與其發(fā)生相關的細菌和病毒,相關研究結果或能幫助檢測致癌微生物,未來有一天或能幫助開發(fā)多種癌癥疫苗,比如HPV疫苗等。


研究者Dan Brewer博士說道,某些感染與癌癥發(fā)生存在明顯關聯(lián),比如,消化道中幽門螺桿菌的存在就會引發(fā)胃潰瘍,并與胃癌發(fā)生直接相關;某些類型的HPV也會引發(fā)宮頸癌;隨著人類進入到基因組醫(yī)學時代,如今研究人員對人類組織進行全基因組測序的工作也越來越多,當對腫瘤樣本進行全基因組測序時,來自任何病原體的DNA也能夠被進行測序,這就有望幫助研究者檢測和定量病原體。


因此,研究人員就能利用所收集的數(shù)據(jù)來識別細菌、病毒和不同類型癌癥之間的關聯(lián);文章中,研究人員開發(fā)了計算機模擬技術,當對真正的癌癥測序數(shù)據(jù)進行分析之前,其能對多種方法就進行驗證,并在這些數(shù)據(jù)中尋找一些有趣的病原體;在模擬實驗中,研究人員制造了包含大部分人類基因組序列的“模擬”基因組,同時還在其中加入了少量的病原體序列,而這正是研究人員希望在癌癥序列中所觀察到的。


當研究者在每一個模擬的基因組中發(fā)現(xiàn)病原體并對其進行定量分析后,他們就能夠檢測每一種方法是否可行;研究者除了發(fā)現(xiàn)與癌癥發(fā)生相關的病原體外,他們還能夠發(fā)現(xiàn)更多病原體,目前研究人員才剛剛開始研究確定這些病原體在癌癥發(fā)生過程中所扮演的關鍵角色。最后研究者Brewer表示,如今人們所注射的HPV疫苗能夠有效預防大約70%的宮頸癌病例,我們希望后期能夠通過更為深入的研究識別出與其它癌癥發(fā)生相關的細菌和病毒,從而開發(fā)出有效預防癌癥發(fā)生的新型疫苗。


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