研究揭示新的肺癌抑癌基因

4月9日，國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》（PNAS）在線發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所季紅斌研究組與暨南大學(xué)生命與健康工程研究院陳良研究組合作的最新研究成果In vivo CRISPR screening unveils histone demethylase UTX as an important epigenetic regulator in lung tumorigenesis。該研究利用CRISPR/Cas9技術(shù)在體進(jìn)行大規(guī)模篩選發(fā)現(xiàn)組蛋白去甲基化酶UTX為新的肺癌抑癌基因，深入揭示了UTX失活促進(jìn)肺癌發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制并提供了潛在的治療策略。

癌癥的發(fā)生普遍被認(rèn)為伴隨著大量的DNA突變，近年來(lái)隨著高通量測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展，癌癥基因組圖譜趨于完善，越來(lái)越多的遺傳改變被研究人員所發(fā)現(xiàn)。在癌癥的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中，抑癌基因的失活在驅(qū)動(dòng)腫瘤惡性進(jìn)展中發(fā)揮了巨大的作用，而如何從大量的基因組突變中區(qū)分和鑒定抑癌基因已經(jīng)成為了癌癥研究中亟待解決的一個(gè)重要問(wèn)題。傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)基因小鼠模型是研究腫瘤發(fā)生發(fā)展的一個(gè)常用工具，費(fèi)時(shí)耗力的缺點(diǎn)顯然已經(jīng)不能滿足大規(guī)模篩選的需求。CRISPR/Cas9技術(shù)近年來(lái)在基因組編輯領(lǐng)域大放光彩，簡(jiǎn)單方便，讓大規(guī)模系統(tǒng)性的在體篩選成為了可能。

在季紅斌和陳良的指導(dǎo)下，博士研究生吳奇標(biāo)等利用76例中國(guó)肺癌病人樣本進(jìn)行基因表達(dá)譜分析與染色體DNA拷貝數(shù)分析，結(jié)合PRECOG數(shù)據(jù)庫(kù)中基因表達(dá)高低與臨床預(yù)后相關(guān)性數(shù)據(jù)和COSMIC數(shù)據(jù)庫(kù)中基因突變頻率信息進(jìn)行整合性生物基因組學(xué)分析，尋找一系列潛在抑癌基因。隨后，利用CRISPR/Cas9技術(shù)在KrasLSL-G12D/+肺癌小鼠模型中進(jìn)行大規(guī)模的篩選，發(fā)現(xiàn)敲除5個(gè)基因Utx，Ptip，Acp5，Acacb和Clu中任意一個(gè)都能夠顯著促進(jìn)肺部腫瘤的發(fā)生發(fā)展。臨床相關(guān)性分析證實(shí)，這5個(gè)基因在人肺癌臨床樣本中均呈現(xiàn)低表達(dá)并且與肺癌病人不良預(yù)后相關(guān)。進(jìn)一步利用KrasLSL-G12D/+；Utxfl/fl轉(zhuǎn)基因小鼠模型證實(shí)，敲除組蛋白去甲基化酶UTX確實(shí)能夠顯著促進(jìn)肺部腫瘤的發(fā)生發(fā)展。機(jī)制研究發(fā)現(xiàn)，敲除UTX能夠通過(guò)EZH2的上調(diào)促進(jìn)H3K27的三甲基化，進(jìn)而下調(diào)經(jīng)典抑癌基因CDKN2A和CDKN2B。更為重要的是，臨床前實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)，EZH2的小分子抑制劑JQEZ5能夠在KrasLSL-G12D/+；Utxfl/fl轉(zhuǎn)基因小鼠模型中達(dá)到很好的治療效果。該項(xiàng)研究闡明了利用CRISPR/Cas9技術(shù)進(jìn)行在體大規(guī)模篩選的策略，揭示了組蛋白甲基化酶UTX促進(jìn)肺癌發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)理并提供了潛在的治療方案。

吳奇標(biāo)、田婭慧、張箭和童欣媛為論文的共同**作者，得到了美國(guó)科赫癌癥綜合研究所教授Tyler Jacks、Wen Xue和Francisco J. Sanchez-Rivera，紐約大學(xué)朗格尼醫(yī)學(xué)中心教授Kwok-Kin Wong和中科院生化細(xì)胞所研究員陳洛南實(shí)驗(yàn)室等的大力支持和幫助。該研究得到中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金委、上海市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)、廣州市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)、中科院上海生命科學(xué)研究院、中國(guó)博士后面上項(xiàng)目與臺(tái)灣青年訪問(wèn)學(xué)者計(jì)劃的經(jīng)費(fèi)資助。