單細(xì)胞測(cè)序平民化，測(cè)一個(gè)細(xì)胞僅需一美分，一次能測(cè)上千個(gè)細(xì)胞！

來(lái)自艾倫學(xué)院和華盛頓大學(xué)的科學(xué)家們開(kāi)發(fā)出了一種廉價(jià)的高級(jí)技術(shù)可以檢測(cè)成百上千個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)。這項(xiàng)基于配位的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)（Split Pool Ligation-based Transcriptome sequencing，SPLiT-seq）是一項(xiàng)可延展的用于表征單個(gè)細(xì)胞RNA水平的技術(shù)，可用于鑒定腦部疾病及其他組織中的不同細(xì)胞類(lèi)型，這項(xiàng)研究于近日發(fā)表在《Science》上。

“研究任何的多細(xì)胞生物系統(tǒng)，我們都需要明白它的基本組件——細(xì)胞?！卑瑐悓W(xué)院科學(xué)家Bosiljka Tasic說(shuō)道?！按竽X包含很多不同形狀和大小的細(xì)胞，但是現(xiàn)在卻沒(méi)有一種方法可以表征它們并進(jìn)行分類(lèi)。在單細(xì)胞水平鑒定RNA是一種鑒定細(xì)胞的方法，但是現(xiàn)有的技術(shù)太昂貴，且需要特殊的設(shè)備。由于SPLiT-seq可以通過(guò)任何實(shí)驗(yàn)室的基礎(chǔ)設(shè)備完成，因此它將廣泛應(yīng)用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究?！?/span>

過(guò)去開(kāi)發(fā)的測(cè)序技術(shù)需要在進(jìn)行基因標(biāo)記之前分離單個(gè)細(xì)胞。而采用SPLiT-seq就不需要再分離細(xì)胞了。取而代之的是，細(xì)胞本身就被作為了一個(gè)自身RNA的分離器。研究人員可以同時(shí)將大量細(xì)胞進(jìn)行RNA標(biāo)記，這個(gè)過(guò)程需要重復(fù)多次，以保證每個(gè)細(xì)胞都具有一組獨(dú)特的組合標(biāo)簽。這使得研究人員可以同時(shí)對(duì)大量的細(xì)胞進(jìn)行基因表達(dá)的測(cè)序，并將它們進(jìn)行分類(lèi)。

“在這個(gè)項(xiàng)目中，我們使用SPLiT-seq對(duì)正在發(fā)育的小鼠大腦和脊髓中超過(guò)150000個(gè)細(xì)胞進(jìn)行了測(cè)序，我們發(fā)現(xiàn)了許多特殊細(xì)胞類(lèi)型的新的分子標(biāo)記物?！比A盛頓大學(xué)電氣工程系合成生物學(xué)家、Paul G.Allen計(jì)算科學(xué)和工程學(xué)院Georg Seelig教授說(shuō)道?！拔覀兊膶?shí)驗(yàn)成本為每個(gè)細(xì)胞一美分。SPLiT-seq顯著降低了實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序的障礙，同時(shí)不需要昂貴的特殊設(shè)備?！?/span>

“任何疾病，包括阿爾茲海默癥和帕金森，都起始于某些細(xì)胞的功能異常?！盩asic說(shuō)道?！疤剿魇悄男┘?xì)胞以及哪些基因出錯(cuò)將幫助我們更深入地了解這些疾病的起因及進(jìn)程，有利于我們開(kāi)發(fā)新的治療方法。”