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繪制出惡性瘧原蟲的藥物可靶向基因組圖譜

2018-01-16 09:51來源:生物谷

在一項(xiàng)新的研究中,來自美國加州大學(xué)圣地亞哥分校等研究機(jī)構(gòu)的研究人員利用全基因組分析和化學(xué)遺傳學(xué)(chemogenetics)方法,在惡性瘧原蟲(Plasmodium falciparum)---一種導(dǎo)致瘧疾的瘧原蟲---的262種瘧原蟲細(xì)胞系中鑒定出新的藥物靶標(biāo)和對(duì)37種不同的抗瘧疾藥物產(chǎn)生抗藥性的抗性基因。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2018年1月12日的Science期刊上,論文標(biāo)題為“Mapping the malaria parasite druggable genome by using in vitro evolution and chemogenomics”。

這項(xiàng)研究證實(shí)了之前已知的有效地導(dǎo)致這種瘧原蟲產(chǎn)生抗藥性的基因修飾,而且也揭示出加深理解這種瘧原蟲潛在生物學(xué)特征的新藥物靶標(biāo)。

論文通信作者、加州大學(xué)圣地亞哥分校醫(yī)學(xué)院兒科系藥理學(xué)與藥物發(fā)現(xiàn)教授Elizabeth Winzeler博士說,“利用惡性瘧原蟲抗性組(resistome)---抗生素抗性基因集合---和它的藥物可靶向(drug-able)的基因組將有助于指導(dǎo)新的藥物發(fā)現(xiàn)工作,和增進(jìn)我們對(duì)這種瘧原蟲如何經(jīng)過進(jìn)化加以反擊的認(rèn)識(shí)?!?/span>

惡性瘧原蟲是通過被感染的瘧蚊(Anopheles mosquitos)的叮咬傳播給人的單細(xì)胞原蟲。它導(dǎo)致大約所有瘧疾病例的一半。瘧疾給人類健康造成巨大影響---據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)估計(jì),2016年全世界有2.16億例瘧疾病例,有44.5萬人死于瘧疾---的部分原因是這種瘧原蟲特別擅長(zhǎng)改變它的基因組來逃避和抵抗藥物治療和人體免疫系統(tǒng)。

Winzeler說,“一次感染能夠?qū)е乱粋€(gè)人體內(nèi)含有超過1萬億個(gè)無性血液階段的瘧原蟲。即便具有相對(duì)較低的隨機(jī)突變率,這些數(shù)字也賦予非凡的適應(yīng)性。在僅幾輪復(fù)制周期中,惡性瘧原蟲基因組就能夠獲得一種隨機(jī)的遺傳改變,這可能導(dǎo)致至少一個(gè)瘧原蟲對(duì)一種藥物或人體編碼的抗體產(chǎn)生抵抗力?!?/span>

這些研究人員說,這種快速的進(jìn)化對(duì)控制這種疾病提出了重大的挑戰(zhàn),但是它也能夠在體外加以利用,以便準(zhǔn)確地記錄這種瘧原蟲在已知的抗瘧疾藥物的存在下如何經(jīng)過進(jìn)化產(chǎn)生抗藥性。它也能夠被用來揭示出新的藥物靶標(biāo)。

Winzeler及其同事們采用了全基因組測(cè)序和多種不同的抗瘧疾化合物,而不是關(guān)注于惡性瘧原蟲與單個(gè)化合物之間的相互作用,或者研究這種瘧原蟲中的潛在抗性基因。所獲得的數(shù)據(jù)集揭示出發(fā)生多種不同的突變??顾幮辕懺x通常在潛在的靶基因中包含突變,而且在其他的無關(guān)基因中也包含額外的突變。

Winzeler說,“我們的研究結(jié)果證實(shí)和強(qiáng)調(diào)了惡性瘧原蟲進(jìn)化出耐藥性是極其復(fù)雜的,但是它們也鑒定出新的藥物靶標(biāo)或者抗藥性瘧原蟲用來對(duì)每種化合物產(chǎn)生抗藥性的抗性基因。它不僅揭示出惡性瘧原蟲的復(fù)雜的化學(xué)遺傳全景,而且也為設(shè)計(jì)新的小分子抑制劑來抵抗這種病原體提供潛在的指導(dǎo)?!?/span>

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